Het werk van de Peter Faber Stichting wordt mogelijk gemaakt door een aantal partners, fondsen en instellingen. Tevens wordt er projectmatig gekeken welke partnerships of samenwerkingsverbanden mogelijk zijn. Op dit moment zijn de voornaamste partners: het Openbaar Ministerie, de Politie en de Gemeente Amsterdam. Voor de financiering van onze projecten zijn we afhankelijk van subsidies en donaties van fondsen en donateurs. Naast een groot aantal kleinere bijdragen van een aantal sponsors hebben twee fondsen de stichting de afgelopen jaren structureel gesubsideerd: de Fundatie van de Santheuvel Sobbe en het steunfonds BJA-COW.